sábado, 31 de enero de 2015

Pruebas Microbiológicas para E. coli

¿Qúe pasa cuando en el laboratorio de Microbiología nos mandan a identificar una cepa problema X y no sabemos que hacer?

Más de un estudiante ha pasado por la situación (a mi, por ejemplo), de no conocer exactamente que medios son los indicados para identificar
una cepa bacteriana específicamente, aunque haya revisado el tema en clases recientes. Por ello es práctico conocer sobre qué tipo de medios las bacterias se diferencian de otras cepas aunque sean metabólicamente muy similares.




 En esta entrada publicaré rasgos relevantes para identificar a la muy estudiada Escherichia coli, que generalmente es la que se utiliza con fines didácticos en los laboratorios de cursos de microbiología o bacteriología por varias razones: es relativamente fácil de obtener y de sembrar, además que hay muchos datos sobre esta especie. Espero le sea útil a algún estudiante que transite por el camino de las ciencias de la vida que pase por mi blog.
Cuando recibimos una muestra es importante definir el algoritmo de pruebas que debe manejarse para lograr identificar el microorganismo de interés. La tinción de Gram nos permite definir si el microorganismo es Gram positivo o Gram negativo en este caso en el frotis debemos observar bacilos Gram negativos para seguir a las siguientes pruebas de caracterización.

E. coli - MacConkey



La mayoría de los microorganismos pueden cultivarse sobre substratos nutritivos para el estudio de sus propiedades o para la utilización de ciertas propiedades en condiciones controladas. La proliferación de bacterias es el resultado de una interacción compleja de diferentes sustancias alimenticias y principios activos dónde intervienen factores físicos como: temperatura, pH, el factor redox entre otras.
Al momento de tener una muestra en donde se desee identificar la presencia de E. coli hay definir que medios de cultivo son selectivos para enterobacterias. Los medios selectivos son muy utilizados cuando se trabaja con muestras que provienen de áreas que poseen una flora abundante.
Los medios selectivos incorporan sustancias inhibidoras de la propagación de un grupo bacteriano que no sea de interés pero en cambio permite el crecimiento de otros grupos.
Para microorganismos entéricos, los medios usados de modo habitual contienen ciertos colorantes e ingredientes que inhiben los organismos gram positivos y permite la propagación  de los bacilos entéricos Gram negativos.

E. coli- Agar EMB



Otra tipos de medio que es una gran herramienta a la hora de la identificación de microorganismos entéricos como la E. coli son los medios diferenciales que poseen componentes químicos e indicadores que permiten identificar con cierta facilidad algunos géneros o especies bacterianas por el aspecto característico que toman sus colonias. Muchos medios selectivos son también diferenciales por ejemplo podemos mencionar:
  • Agar Salmonella – Shigella: Se utiliza para aislar bacterias lactosa negativa como Salmonella y Shigella. Especies de la familia Enterobacteriaceae lactosa – positivas, como Escherichia coli, presentan colonias rosadas en este tipo de medio.
  • Agar Tergitol 7: Este medio permite diferenciar especies fermentadoras de la lactosa de las especies no fermentadoras. En este medio Escherichia coli presenta colonias amarillas.
  • Agar MacConkey: Al igual que el anterior separa las bacterias fermentadoras de la lactosa. Escherichia coli produce colonias rosadas.
  • Agar Eosina – Azul de Metileno (EMB) de Levine: Permite la diferenciación de especies fermentadoras de la lactosa. Klebsiella pneumoniae y Escherichia coli presentan colonias que varían del púrpura a verde metálico.
Pruebas Bioquímicas son  la forma más convincente del diagnóstico de las enfermedades infecciosas, mediante este proceso se determinan el género y las especies bacterianas de interés. Cada tipo bacteriano tiene un cuadro de reacciones específicas donde se comprueba el resultado de las reacciones y son la base de la identificación de los diferentes agentes bacterianos. En general para la identificación de enterobacterias se sugiere realizar las siguientes pruebas:
  • Agar TSI: Es un medio de cultivo diferencial basado en la capacidad de los bacilos gram negativos de fermentar carbohidratos, de producir H2S y producir gas.
    • Se observa en el tubo el pico y el fondo ácido, hay 1% de positividad para la producción de H2S en cepas de E. coli.
  • Prueba de orto-nitrofenil-β-galactopiranósido (ONPG): Esta prueba detecta la producción de  la enzima β-galactosidasa y permite diferenciar organismos de lenta utilización de la lactosa de aquellos que no la utilizan. La enzima β-galactosidasa es codificada por el gen lacZ del operón lactosa, el cual es  inducido en presencia de lactosa y ausencia de glucosa. Por lo tanto, se requiere que las bacterias hayan sido crecidas en un medio con lactosa como el Agar TSI o el Agar MacConkey.
    • E. coli es positiva para esta prueba
  • Prueba de movilidad: Esta prueba determina la movilidad de los bacilos fermentadores.
    • 95% de positividad para cepas de E. coli.
  • Prueba de gelatinasa: Determina la producción de la enzima gelatinasa, la cual produce la hidrólisis de la gelatina.
    • E. coli es negativa para esta prueba
  • Prueba de rojo de metilo (RM): Identifica especies de bacterias que producen ácidos a partir de glucosa.
    • 99% de positividad para cepas de E. coli.
  • Prueba de Voges – Proskauer (VP): En esta prueba se detecta la producción de acetil-metilcarbinol (acetoína), el cual se convierte a diacetilo en presencia de KOH y O2 atmosférico. El diacetilo es convertido posteriormente en un complejo rojo en presencia de α-naftol y creatinina. La producción de acetoína es una vía alternativa del metabolismo del ácido pirúvico, donde se producen cantidades pequeñas de ácidos mixtos que pueden ser insuficientes para dar una prueba RM positiva. Por este motivo, la mayoría de las especies de la familia Enterobacteriaceae son VP positivo y RM negativo y viceversa.
    • esta prueba es negativa para cepas de E. coli.
  • Prueba de fenilalanina desaminasa: La determinación de la enzima fenilalanina desaminasa es útil para diferenciar inicialmente a las especies de: Proteus, Morganella y Providencia de otros bacilos gram negativos.
    • 0% de positividad para cepas de E. coli.
  • Producción de descarboxilasas y dehidrolasas de aminoácidos: Muchas especies bacterianas poseen enzimas que tienen la capacidad de descarboxilar o de hidrolizar aminoácidos específicos entre ellos la arginina, lisina, ornitina en pruebas específicas, liberando animas de reacción alcalina y CO2.
    • 17% de positividad para Arginina.
    • 90% de positividad para Lisina.
    • 65% de positividad para Ornitina.
  • Prueba de Ureasa: Los microorganismos que hidrolizan la urea a través de la enzima ureasa, liberan amoníaco lo cual produce un cambio de color rojo en el medio. El agar urea de Christensen permite la detección de menores cantidades de amoníaco para aquellos microorganismos que producen menores cantidades de ureasa se evalúan con este método.
    • 1% de positividad para esta prueba en E. coli.
  • Producción de Indol: El indol es uno de los productos de la degradación del aminoácido triptofano.  Para su detección la bacteria es cultivada en caldo triptona y posteriormente se utiliza el reactivo de Ehrlich, el cual es más sensible que el reactivo de Kovacs cuando se estudian bacilos no fermentadores o anaerobios cuya producción de indol es mínima.
    • 98% de positividad para esta prueba en E. coli.
  • Utilización de citrato: Esta prueba determina la capacidad de un microorganismo de utilizar el citrato de sodio como única fuente de carbono para el metabolismo y crecimiento.
    • 1% de positividad para cepas de E. coli.
  • Utilización de malonato: Esta prueba determina la capacidad de algunas bacterias de utilizar el malonato como fuente de carbono y energía.
    • 95% de positividad para cepas de E. coli.
  • Prueba de reducción de nitratos: Determina la capacidad de reducir el nitrato a nitrito o gas. Es útil en la identificación de la familia Enterobacteriaceae y en la diferenciación de especies de muchos otros grupos de microorganismos.
    • E. coli es negativa para esta prueba
  • Prueba de fermentación de carbohidratos: Se recomienda el uso del caldo de base púrpura de bromocresol conteniendo un determinado sustrato a una concentración del 1% para la determinación de la fermentación de carbohidratos y alcoholes para especies de la familia Enterobacteriaceae.
    • D-Sorbitol 94% de positividad.
    • Lactosa 95% de positividad.
    • Sacarosa 50% de positividad.
    • D-Manitol 98% de positividad.
    • D-Adonitol 5% de positividad.
    • L-Arabinosa 99% de positividad.
    • Maltosa 96% de positividad.
Fuente:
Rojas N, Chaves E, García F (2006) Bacteriología Diagnóstica, Costa Rica, Universidad de Costa Rica, Facultad de Microbiología.
García R, Córdoba R, (1988) Manual Ilustrado para Laboratorio de Bacteriología y Micología Veterinaria



Espero sea útil a quien lo lea. Gracias por pasarte!




 

martes, 27 de enero de 2015

"Grandes Héroes"

ATENCIÓN: La reseña que voy a escribir está basada en mi percepción y mis gustos, no soy ninguna calificada para puntuar; es decir, es totalmente subjetiva mi observación. Si alguien lee esto y no está de acuero, comente con respeto.

El 6 de enero fui a ver en 3D la película "Grandes Héroes". La verdad, fui con mucho escepticismo a verla porque últimamente Disney me ha dejado con mal sabor de boca: películas como Frozen y Maléfica me han decepcionado y, cabe destacar, yo soy seguidora de las películas de Disney jejeje.



Pero, Grandes Héroes me ha dejado con una bonita sensación. Causó en mí emociones que fueron de la risa hasta soltar una lagrimita por escenas que me conmovieron.

  Personajes carismáticos, una animación bastante buena y una historia que deja atrae desde niños hasta frikis (jejeje) son las cartas fuertes de esta cinta.
La historia habla de un chico prodigio en la robótica, llamado Hiro Hamada. Diseña robots de avanzada tecnología los cuales utiliza para combatir en peleas ilegales de robots.
Tadashi Hamada, su hermano mayor, lo convence de estudiar en la universidad para que use su talento en la robótica en provecho de la humanidad. Hiro pierde a Tadashi de una manera trágica y, además, luego de este hecho, descubre que  alguien está usando su invento (un invento que Hiro diseñó para entrar a la universidad en Robótica)

 Con la ayuda de Baymax, un robot que Tadashi inventó, y con sus amigos, descubrirá que hay detrás de ese quien se esconde tras una máscara de Tabuki, ese alguien que obviamente no tiene muy buenas intenciones.

Salvo un par de cosas que no quedan muy claras en el guión y que, por ende, no terminó de convencerme, ver Grandes Héroes  en el cine valió la pena (y ya sabemos que ir al cine pues no es tan barato, al menos no en Venezuela)

La banda sonora tampoco es algo que destaque mucho en la cinta, sin embargo, las pistas no son aburridas.

Yo la puntuaría como 8,5/10



Y eso es todo. Gracias a quien haya dedicado su tiempo a leer post.

viernes, 16 de enero de 2015

Gritar y que no te escuchen.

Hay veces en que simplemente no puedes más: el peso que cargas en tu alma, sumado a lo estresante que es ver como pasan los días y no consigues cambiar nada es una de las sensaciones más terriblemente frustrantes que se pueden vivir.

Hay veces en que todo lo que cargas cae sobre ti como una pesada losa; hay veces en que sientes que una tormenta te va  a llevar y sabes que se acerca cuando sientes los truenos y ves los relámpagos, manifestados como esas lágrimas que mueren por salir a expresar todo el dolor y esa irregular respiración en tu pecho, a cual no eres capaz de controlar.

A veces, simplemente uno quiere gritar sin que lo escuchen; sabes que quieres hablar, pero no quieres obligar a que te oigan.

¿Contradictorio? Si, tal vez así sea, pero es que lo cierto es que los demás no tienen que cargar con tus problemas, siempre pienso que debo salir por mí misma, aunque casi nunca lo consigo.

No me gusta la sensación de que estoy obligando a alguien a que me comprenda.

No quiero obligar a nadie, no quiero despertar la lástima de los demás.


Y es en estos momentos en los que realmente escribir me es un gran alivio: donde puedo llorar sin que me vean, donde puedo gritar sin que me escuchen, sin que vengan a decirme con lástima ¿qué te pasa?. Como si estuviesen obligados, ya sea por moral, buena educación o lo que sea.


lunes, 5 de enero de 2015

Año Nuevo, cosas nuevas

Cuando inicia un año nuevo, todos se proponen cosas: algunos quieren cumplir una meta, otros quieren obtener algo; otros tantos desean mejorar su salud o mejorar sus relaciones, incluso, hasta conseguir novio/a.

Yo la verdad, espero que este año me vaya mejor que el anterior. Este año 2014 fue un tanto traumático y mi diciembre 2014 no fue el mejor (problemas bien graves con mi familia de la magnitud como la pantalla azul de error en Windows D:)

Lo cierto es que un año nuevo no será el mejor simplemente deseándolo, hay que trabajarlo.
Como dije, deseo que este año me vaya mejor, pero no desde la simple perspectiva "quiero que...". no, así no. deseo que este año surja esa fuerza que me de el poder para trabajar y luchar para que todos esos miedos, esos demonios internos que viven en mi y no me dejan avanzar, se desplazen.


Así que, para quien esté leyendo esto pues, aconsejo que saquen esa fuerza para luchar contra su peor enemigo: esa sombra que viven en su interior y que por sí sola no es mala; empieza a serlo cuando le permitimos nque no nos deje avanzar.




Feliz 2015

domingo, 4 de enero de 2015

Saludos

Me presento. Me conocen como Yami por donde vivo, es mi apodo. Soy una venezolana que vive en una isla (yeah, altas temperaturas tooodo el año >_<) la Isla de Margarita.
Le he puesto Sea Dragon como nombre a este blog (probablemente se lo cambie luego, o modifique, quien sabe) por dos razones principales:
1) soy fan a morir de Saint Seiya/ Los Caballeros del Zodiaco.
2) estudio Licenciatura en Biología Marina, me identifico mucho con (y aquí se enlaza con el primer punto) Kanon del Dragón Marino. (En sí, con todas los Marinos de Poseidón). Además, mi signo es Géminis.

Me tengo gustos que, para la gran mayoría de la sociedad (y más para los países latinos que, me parece que son un poco intolerantes o que rechazan a lo "desconocido"), no son comunes o se denominan raros:siento un gran amor por la cultura del país del Sol Naciente. Ojo, no con esto me limito únicamente a que me gusta ver anime y leer manga. Me chocan los otakus que se creen ya japoneses porque ven mucho anime, pero no saben que es Akihabara. Siento pasión y amor cada que leo sus leyendas, admiro sus costumbres, su geografía y su sentido de la moda alternativo que, a su vez, tienen un significado tras este.

Esos gustos los reflejo en mi manera de vestir básicamente. Me inspiro en estos estilos y los añado a mi vestuario. Lo cual no quiere decir que siga al pie de la letra un único estilo. Seguramente (y sé que lo soy) para una lolita soy una verdadera ITA.

En este blog pretendo compartir muchas cosas, desde alguna experiencia mía, pasando por algo de moda, consejos de todo tipo, reseñas de algo en particular sobre entretenimiento, hasta cosas sobre mi carrera. Espero les guste y me sigan.

Gracias por leer.